È vero. Anche questa è una limitazione di XLogoOnline. Si possono usare i colori ma solo per disegnare e non per riempire le figure. I colori si controllano nei modi descritti a partire da pagina 26 del manuale specifico di XLogoOnline, di cui riporto anche qui il link: https://www.abz.inf.ethz.ch/wp-content/uploads/2018/04/logo_heft_it.pdf.
In qualche modo si può ovviare utilizzando la possibilità di disegnare con un tratto di penna di spessori maggiori (vedi pag. 20 del medesimo manuale) anche se non è proprio la sgtessa cosa.
Effettivamente, si tratta di una limitazione dal punto di vista della produzione di grafiche più vistose ma sotto il profilo degli obiettivi didattici questo non è un problema perché l'enfasi è sul ragionamento, ragionamento geometrico e matematico.